Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACFD1Q9UGQ2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACFD1Q9UGQ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms