Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms