Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms