Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPASTQ9UBP0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms