Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms