Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDP1Q9P0J1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms