Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms