Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms