Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A2Q9NTI2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms