Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP7BPQ9NSQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms