Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms