Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms