Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4Q9NQC3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms