Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms