Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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