Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms