Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms