Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms