Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms