Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX2Q9BZI1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX2Q9BZI1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms