Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms