Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLVAPQ9BX97 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms