Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms