Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms