Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms