Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms