Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms