Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USB1Q9BQ65 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USB1Q9BQ65 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms