Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms