Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms