Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCLT1Q96NL6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms