Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms