Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms