Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms