Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms