Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms