Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms