Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM52Q96A61 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms