Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms