Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms