Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBLCP1Q8WVY7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBLCP1Q8WVY7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms