Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms