Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms