Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINC00116Q8NCU8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00116Q8NCU8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms