Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms