Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms