Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC17Q8N6Y2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms