Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP4Q86YS3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms