Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTU1Q7Z7A3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms