Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms